La agroecología en México, comprende un complejo entramado en conjunto con la ciencia, los movimientos socioculturales y las prácticas agroecológicas que realizan los agricultores; y esto cada vez más suele disputarse a escalas de análisis más amplias. En este contexto, las relaciones horizontales y el intercambio de conocimientos entre los actores involucrados, pueden solucionar problemas ecológicos y sociales para lograr llevar a escala la agroecología. En este sentido, el objetivo de este trabajo fue presentar y discutir experiencias metodológicas de la agroecología desde su aplicación. Para ello, resultó primordial reflexionar sobre las experiencias de articulación de investigadores, técnicos extensionistas, organizaciones y los actores locales en el proceso de investigación agroecológica. Estas experiencias se describieron, analizaron y discutieron para determinar la forma en que fueron integrados los actores involucrados y de esta manera hacer la conexión de la agroecología como praxis social desde sus tres significaciones (ciencia, práctica y movimiento). Cada experiencia describe los aprendizajes, limitantes y su contribución a la agroecología en México. Las experiencias presentadas muestran la integración de diversos actores en los procesos de aplicación de la agroecología desde sus tres significaciones, a través de relaciones horizontales e intercambio de conocimientos que pueden contribuir en los problemas de tipo ecológico y social, que son pieza clave para lograr llevar la agroecología a escala. Se evidenció que la agroecología no solo incluye a los agricultores, también a los técnicos, extensionistas, organizaciones públicas y privadas, académicos, investigadores, así como los actores gubernamentales en todos sus niveles. Por lo tanto, el éxito del escalamiento de la agroecología en México, sugiere la integración de los actores para comprender cómo se relacionan y entrelazan en los proyectos agroecológicos individuales y colectivos. Este entramado de actores, sugiere nuevos desafíos y un nuevo rol de la investigación científica, donde nuevas metodologías y enfoques multidisciplinarios tomen relevancia como respuesta a estos fenómenos complejos contemporáneos. Además, en el marco de las nuevas políticas del gobierno mexicano, las experiencias presentadas, contribuyen a las acciones encaminadas en el Plan Nacional de Agroecología, por lo que se presenta una oportunidad importante para que a partir de estas experiencias se logre llevar la agroecología a escala.