La Maestría en Ciencias en Desarrollo Rural Regional (MCDRR) fue fundada en 1991, con más de 30 años de vigencia, es un posgrado consolidado con cuatro grupos operativos: Chapingo, Estado de México (Campus central), San Cristóbal de las Casas, Chiapas; Morelia, Michoacán (Centro Regional Universitario de Centro-Occidente-CRUCO) y Zacatecas, Zacatecas (Centro Regional Universitario de Centro-Norte (CRUCEN). Este programa está registrado en el Sistema Nacional de Posgrados (SEP-CONAHCYT).

El Doctorado en Ciencias en Desarrollo Rural Regional (DCDRR) inició actividades académicas en 2014 y cuenta con el registro en el Sistema Nacional de Posgrados (SEP-CONAHCYT).