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Clonado y caracterización de beta-3-chimaerin: una novedosa isoforma de la familia de las Quimerinas
Lautaro Zubeldia Brenner.
Tesis de Licenciatura. DEPARTAMENTO DE FISIOLOGIA, BIOLOGIA MOLECULAR Y CELULAR ; FACULTAD DE CIENCIAS EXACTAS Y NATURALES ; UNIVERSIDAD DE BUENOS AIRES.
  ARK: https://n2t.net/ark:/13683/ptoZ/yba
Resumen
Las chimaerins o quimerinas son una familia de receptores para el segundo mensajero diacilglicerol (DAG) y los ésteres de forbol, con actividad de GAP específica para Rac. Están codificadas en dos genes alfa y beta que dan lugar a las cuatro isoformas reportadas hasta el momento: alfa-1, alfa-2, beta-1 y beta2-chimaerin. Las quimerinas poseen en su extremo C-terminal un dominio de GAP específico para Rac y un dominio C1 capaz de unir DAG y ésteres de forbol con alta afinidad similar al que poseen las PKC. Además, alfa2 y beta2 poseen en su extremo N-terminal un dominio SH2 capaz de unir proteínas fosforiladas en tirosinas y un dominio autoinhibitorio responsable de la regulación de su actividad de GAP por DAG. Para estas dos isoformas se describió un mecanismo de activación alostérica por unión a DAG y fosfolípidos de membrana. En ausencia de ligando, la proteína se encuentra en una conformación cerrada en el citoplasma, con el dominio C1 enterrado en la estructura terciaria con interacciones intermoleculares con los dominios GAP y SH2 y con el alfa-hélice N-terminal que, además, posee dos residuos que se insertan en el dominio de GAP inactivándolo. Experimentos de Western blot para varios tejidos de ratón utilizando un anticuerpo especifico anti-quimerinas mostraron la presencia de una isoforma de peso molecular aparente 10 KDa mayor a beta2-chimaerin en riñón, glándula adrenal y corazón. Haciendo una búsqueda de secuencias relacionadas a beta2-chimaerin en las bases de datos del NCBI se encontraron varios EST provenientes de tumor de riñón humano y amígdala cerebral que codificaban para una isoforma con un extremo N-terminal novedoso y considerablemente mas grande desconocido en la familia de las quimerinas. Haciendo un análisis in silico de estas secuencias se observó que este extremo N-terminal esta codificado en el genoma por dos exones que se encuentran 48 Kb río arriba del sitio de inicio de la transcripción de beta2-chimaerin y río abajo de secuencias promotoras. En base a estas evidencias se llevó a cabo el clonado molecular de una nueva isoforma de la familia de las quimerinas que denominamos beta3-chimaerin. La secuencia codificante fue levantada por PCR de dos cDNA comerciales humanos provenientes de riñón y de encéfalo y luego fue subclonada en distintos vectores de expresión. Esta nueva isoforma fue reportada al GeneBank a nombre del autor de la presente tesis y de su director y se le asigno el código: bankit1266590 GQ924106. Con el objetivo de medir la unión de ésteres de forbol por beta-3-chimaerin en un contexto celular se realizaron estudios de translocación in vivo en los cuales células COS-1 fueron transfectadas con plásmidos que codifican para beta-3-chimaerin y tratadas con concentraciones crecientes de PMA. beta-3-chimaerin mostró ser 7 veces mas sensible al PMA que lo reportado para las proteínas beta-2-chimaerin y alfa-2-chimaerin con un EC50 = 180,6 nM. Nuestro próximo objetivo será determinar la actividad de beta-3-chimaerin como RacGAP, su regulación por DAG y ésteres de forbol y elucidar el papel de su extremo N-terminal en su regulación.
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