Este artículo pretende enfatizar las problemáticas ocultas de los acuerdos de Cooperación Sur-Sur Regional (CSSR) en el área educativa no consideradas en el juego de toma de decisiones dentro de los procesos de integración que incentiva el MERCOSUR a partir del 2006 afectando directamente a la población objetivo de zonas de frontera. Esta problemática surge a partir de la importancia que posee la variable educativa como una pieza central en la construcción de libertad ciudadana -en términos de derechos y deberes del ciudadano- que hace a la dimensión social y humana del desarrollo socio-económico de los países latinoamericanos. En un contexto en el cual la CSSR protagoniza un debate de vanguardia en la región latinoamericana, los países miembros y asociados del MERCOSUR ejecutan el Plan del Sector Educativo del MERCOSUR 2011-2015. A su vez, éste subraya la articulación de los compromisos asumidos en la XX Cumbre Iberoamericana para abordar los principales desafíos educativos de la región condensados en el Programa "Metas 2021: la educación que queremos para la generación de los Bicentenarios". El paper se propone señalar la importancia de la CSSR en el área educativa como variable profundizadora de los procesos de desarrollo nacional y regional en América Latina, y además resaltar una de las problemáticas propias de la dimensión educativa que está siendo débilmente considerada en los procesos de integración educativa del MERCOSUR, ésta es las tensiones lingüísticas que se podrían generar en acuerdos de CSSR que involucran poblaciones indígenas, sustancialmente en zonas de frontera.